Сроки обращения в суд, Суд ссылается на утраченные сроки

Здравствуйте. Уважаемые юристы! Я, работал у работодателя (юридическое лицо) с января 2001г. до середины марта 2002г. Ежемесячно заключались договора гражданского - правового характера на предмет оплаты труда с января 01г. по февраль 02г. На каждый месяц есть расчётный лист с расшифровкой о начисление оклада, премии, надбавок северных - районных и удержания подоходного налога. В марте договор не заключался, был отстранён от работ за то, что потребовал оформление договора надлежащим образом. Приказы о приёме и увольнении не готовились, об увольнении заранее не предупреждался, трудовая книжка не принималась и не выдавалась. Так как отношения были гражданские.
При устройстве на работу в другую организацию, в сентябре 2003г., до сей поры я, не был трудоустроен, при просмотре трудовой книжки, инспектор поинтересовалась об отсутствие записи длительное время. Я рассказал, как и где работал. Инспектор удивилась, что удерживались налоги, а запись не внесли, что нужно обратится к работодателю и внести запись. По моей настоятельной просьбе, была сделана запись (01. 01. 2001. Принят прорабом по договору подряда. 30. 03. 2002 Уволен в связи с окончанием срока действия договора). В графе - на основании чего внесена запись (документ, его дата и номер) - записи отсутствуют. Показав вновь инспектору трудовую, она заявила, что запись неверная. Я обратился в Трудовую инспекцию с вопросам, как изменить запись, и не нарушены ли мои права. Правовой инспектор по труду ответила, что не вправе вмешиваться в наши отношения пока в судебном порядке не будет установлено, что договором гражданскою - правового характера фактически регулируются трудовые отношения между работником и работодателем, сославшись на Ст.11 Т.К., предложив самостоятельно с заявлением об изменении записи, обратиться к работодателю. Я так и сделал. Работодатель отказался изменить запись, сославшись, что запись уже сделана.
Я обратился в Суд с заявлением о признании трудовых отношений согласно Ст. 15 Т.К. На вопрос о восстановлении нарушенных прав, такие как отпускная компенсация, за проработанный период и восстановление на работу, суд с ссылаясь на Ст.392 Т.К. утверждает, что просрочены сроки.
Уважаемые господа юристы! Посоветуйте как быть, как исключить Ст. 392 Т.К.
Пока суд не признал трудовые отношения значит нет и нарушений, значит нет и даты срока?
С уважением Костик.

В каком акте суд "утверждает"?
В какой стадии процесс?